Para Azorín esta novela resume mejor que ninguna el espíritu de Baroja.
Y efectivamente: sus principios filosóficos y sociales, la reacción frente a la miseria y el dolor, y los elementos autobiográficos hacen de esta obra muestra privilegiada del mundo del autor. Médico, como Baroja, el protagonista de «El árbol de la ciencia» asiste impotente a los desafueros de una sociedad mezquina y envilecida. Entre el determinismo fisiológico y la rebelión moral hay la búsqueda de un camino propio.

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I. Introducción. 1. Aclaración. 2. El novelista. 3. La época. El ambiente. 4. La ciencia. 5. Biografía y novela. 6. La muerte. II. Esta edición. III. Bibliografía. IV. Texto y notas de 'El árbol de la ciencia'.