La actividad de los tribunales eclesiásticos es un tema altamente interesante por la novedad institucional que supone y porque es una nueva fuente para conocer las relaciones entre sociedad colonial y sociedad indígena, instituciones de poder, religiosidad y los posibles sincretismos o yuxtaposiciones.

Por otra parte, las fuentes fruto de la actividad de estos tribunales ofrecen información de gran calado sobre la religiosidad indígena en la época virreinal, el grado de asimilación de la religión católica o su rechazo, variaciones en las creencias y rituales indígenas respecto a la época prehispánica, etc.

A pesar de no contar con las series cronológicas completas, los documentos emanados del prelado, de su tribunal o de los curas de las diferentes parroquias, permiten seguir ese estudio desde el siglo XVI hasta la independencia.